大年初一,浙大发顶刊论文:用人工智能为膜蛋白造“装甲”
中国青年报客户端杭州2月17日电(查蒙 中青报·中青网记者蒋雨彤)大年初一,浙江大学以《De novo Design of GPCR Exoframe Modulators》为题,在Nature上发表了农历新年的首篇论文,展示了人工智能在膜蛋白设计与功能重构方面的实际能力,为理解和利用G蛋白偶联受体跨膜调节蛋白(GPCR Exoframe Modulator,GEM)调控潜力提供了一种新的技术路径。

本研究的第一作者为浙江大学“医药+X”多学科交叉博士研究生程诗卓,浙江大学医学院郭嘉、周云利、罗序梅,苏州大学药学院张谷芳。通讯作者为张岩和章敏。
而这篇论文的投稿,恰好就发生在一年前的大年初一。
作为人体最大的“信号接收器”,G蛋白偶联受体(GPCR)分布在全身各大组织内,通过七条跨膜螺旋,调控着感觉、情绪、心血管、代谢等几乎所有关键的生命过程。

针对这一重要的信号枢纽,浙江大学医学院、良渚实验室张岩团队与计算机学院章敏团队开展交叉合作,提出了一种“外骨骼式”的受体调控思路。不同于传统药物主要通过占据受体正构口袋来影响功能,GEM作用于GPCR的跨膜域,直接改变受体的构象状态,从而实现对其信号输出方式的精细调节。他们还进一步将人工智能设计的GEM模块与GPCR本体进行融合,通过直接改变受体的构象状态,使经典意义上“七次跨膜螺旋”,扩展为九次甚至十三次,从而调控人工GPCR受体下游信号通路及其相应功能。
作为计算机背景、与医学学科交叉培养的博士生,程诗卓一周要分别在医学组、计算机组和交叉组开三次组会,学习医学知识、夯实计算机技能并不断和导师们头脑风暴,把神秘的生物遗传密码转化为有逻辑规律的计算机语言。令人惊喜的是,团队发现这套体系赋予蛋白设计的“可控能力”远超预期。

浙江大学医学院副院长张岩说:“我们希望通过这种方式,为一类长期缺乏有效干预手段的GPCR功能障碍疾病,比如部分帕金森样综合征,提供新的治疗思路。”









